Ученые из Токийского университета обнаружили гигантские элементы ДНК, скрытые в ротовой полости человека. Новая находка получила название Inocles и может быть связана не только с заболеваниями десен, но и с риском развития рака, пишет ScienceDaily.
Исследователи отмечают, что около 74% населения Земли могут быть носителями этих генетических элементов. Несмотря на десятилетия изучения микробиома ротовой полости, Inocles оставались незамеченными из-за технических ограничений.
Inocles представляют собой внехромосомную ДНК — генетический материал, существующий в клетках бактерий отдельно от их основной ДНК. Их средний размер составляет около 350 тысяч пар оснований, что в десятки раз превышает размеры обычных плазмид. Благодаря этому Inocles несут набор генов, которые могут обеспечивать бактериям устойчивость к окислительному стрессу, способность к ремонту ДНК и защиту клеточной стенки.
Чтобы обнаружить скрытые элементы, команда ученых применила метод длинного чтения ДНК, а также специальную технику удаления человеческой ДНК из образцов слюны. Это позволило впервые собрать полный геном Inocles, найденных у бактерии Streptococcus salivarius.
По словам ведущего автора исследования Юи Кигучи, теперь ученым предстоит понять, как именно Inocles влияют на взаимодействие человека и его микробиоты:
«Мы знаем, что в микробиоме рта много разных бактерий, но их функции до конца не изучены. Inocles могут стать недостающим звеном в понимании того, как микробы адаптируются и влияют на здоровье. Есть основания полагать, что они могут быть связаны с заболеваниями десен и даже онкологией».
В дальнейшем исследователи планируют культивировать бактерии, содержащие Inocles, чтобы изучить их свойства, а также использовать компьютерное моделирование для прогнозирования функций неизвестных генов.
Эта находка открывает новое направление в медицине и может привести к созданию методов ранней диагностики или профилактики серьезных заболеваний.